在生物學實驗中，同一抗體在不同條件下進行電泳等分析時，跑出來的分子量卻不一樣，常常會出現這樣的事情。有以下幾個方面因素：

1. 抗體本身的結構特點

抗體是具有4條多肽鏈的對稱結構，包含2條較長、相對分子量較大的相同重鏈（H鏈）和2條較短、相對分子量較小的相同輕鏈（L鏈），鏈間由二硫鍵和非共價鍵聯結形成一個由4條多肽鏈構成的單體分子 。抗體存在多種形式，除了常見的單體形式，還可以形成多聚體。比如，IgM抗體在體內通常以五聚體形式存在，而在某些實驗條件下，其聚合狀態可能發生改變，從五聚體解離成單體或其他聚合程度不同的形式。這種聚合狀態的變化會直接影響其在電泳等分析中的遷移率，從而表現出不同的分子量。

2.翻譯后修飾也會影響抗體分子量

抗體在細胞內合成后，會經歷一系列的翻譯后修飾過程，其中糖基化最為常見。不同的細胞表達系統，由于其自身的糖基化酶種類、活性以及細胞內環境等因素的差異，會導致抗體糖基化程度不同。

以在哺乳動物細胞和昆蟲細胞中表達的同一抗體為例，哺乳動物細胞表達的抗體可能具有更復雜、多樣化的糖基化修飾，而昆蟲細胞表達的抗體糖基化程度相對較低。糖基化的差異會使抗體的分子量增加不同的程度，進而在電泳等實驗中呈現出不同的分子量結果。此外，磷酸化、乙酰化等其他翻譯后修飾方式，也在一定程度上改變抗體的電荷性質和分子大小，影響其在電場中的遷移行為，造成分子量測定的差異。

3.實驗條件不同

3.1電泳緩沖液的成分和pH值對抗體的遷移有顯著影響：不同的緩沖液配方會影響抗體分子所帶的電荷數量和性質。例如，在pH值較高的緩沖液中，抗體分子帶有更多的負電荷，遷移速度相對較快；而在pH值較低的緩沖液中，電荷數量和性質的改變使遷移速度發生變化，最終導致分子量測定結果出現偏差。

3.2樣品處理過程：在制備樣品時，還原劑的使用與否以及其濃度會影響抗體分子間二硫鍵的狀態。如果二硫鍵沒有被充分還原，抗體會以多聚體或部分折疊的形式存在，導致遷移異常。同時，樣品的上樣量如果過大，會造成電泳條帶的擴散和拖尾現象，影響對分子量的準確判斷。

3.3 凝膠的濃度和交聯度也會對抗體的遷移產生影響：不同濃度的凝膠孔徑大小不同，抗體在不同孔徑的凝膠中遷移的阻力不同。一般來說，較高濃度的凝膠孔徑較小，適合分離分子量較小的蛋白質或抗體；而較低濃度的凝膠孔徑較大，更有利于分子量較大的抗體遷移。如果在實驗中選擇了不合適的凝膠濃度，就導致抗體遷移異常，出現分子量測定不準確的情況。

3.4 儀器設備的差異以及校準情況：不同品牌和型號的電泳儀、成像系統等設備，其性能參數和分辨率存在差異。而且，如果儀器沒有定期進行校準和維護，也會影響實驗結果的準確性，使得同一抗體在不同設備上跑出不同的分子量。

在進行實驗時，我們需要充分考慮這些因素，盡可能優化實驗條件，準確分析實驗結果，以獲得可靠的抗體分子量數據。